W reakcji katalizowanej enzymem substrat nazywany jest substratem. Substrat znajduje i wiąże się z aktywnym miejscem enzymu, a następnie tworzy kompleks enzym-substrat.
Kiedy enzym katalizuje reakcję chemiczną, enzym pomaga w reakcji i często przyspiesza tempo reakcji. Aktywne miejsce enzymu jest specyficznym obszarem, do którego pasuje substrat. Kiedy substrat pasuje do aktywnego miejsca i tworzy kompleks enzym-substrat, cząsteczki substratu są zorientowane i wiązania są osłabione. To katalizuje reakcję, ponieważ nowe wiązania mogą wtedy łatwiej tworzyć się.