Eubakterie są uważane za "prawdziwe bakterie", według Reference.com. Charakteryzują się brakiem błony jądrowej, pojedynczego okrągłego chromosomu i mają ściany komórkowe złożone z peptydoglikanu.
Popularny system klasyfikacji dzieli wszystkie żywe istoty na trzy domeny: eubakterie, archeony i eukarioty. Słowo "eubacteria" pochodzi od słów "eu", co oznacza "prawda" i "bakterie". Eubakterie są prokariotami, co oznacza, że mają prymitywne jądro. Materiał jądrowy bakterii nie jest związany przez odrębną błonę jądrową, tak jak w eukariotach. Również bakteryjny materiał genetyczny lub DNA występuje w postaci pojedynczego kolistego chromosomu.
Ściana komórkowa bakterii składa się z peptydoglikanu, w przeciwieństwie do celulozy, jak w roślinach. Są to organizmy jednokomórkowe i najczęściej rozmnażają się przez rozszczepienie binarne. Eubakterie są ruchliwe lub nieruchliwe. Ruchliwa bakteria jest w stanie się poruszać, ze względu na obecność wici.
Eubakterie mogą tworzyć zarodniki, które pozwalają im przetrwać przez długi czas w niekorzystnych warunkach, zauważa Augusta Technical College. Eubakterie są dalej klasyfikowane jako albo bakterie Gram-dodatnie, albo bakterie Gram-ujemne, w zależności od tego, czy przyjmują one plamę grama. Eubakterie i Archaebacteria ewoluowały od wspólnego przodka, ale mają wystarczająco dużo różnic, aby zasługiwać na dwie odrębne domeny w klasyfikacji żywych istot.