Protiści żyją w jeziorach, rzekach, oceanach, stawach i mokrych osadach. Ponieważ są mikroskopijnymi organizmami, mogą żyć w niemal każdej części świata, która ma ślady wody w celu podtrzymania ich życia .
Niektóre z najczęstszych grup protistów, które można znaleźć w rzekach, jeziorach, oceanach i innych zbiornikach wodnych, to:
Flagellates: Są najmniejsze w porównaniu do innych protistów. Poruszają się za pomocą wici, która napędza ich wszędzie tam, gdzie chcą się udać.
Ciliates: Ciliates poruszają się za pomocą delikatnych, podobnych do włosów funkcji, które zwykle określa się mianem rzęsek. Rzęski czynią ich dobrymi pływakami, mimo że są największą z różnych grup protistów.
Sporozoa: Ci protistowie nie mogą poruszać się samodzielnie, ponieważ nie mają żadnych funkcji ruchu. Sporozoa są z natury pasożytami, a więc polegają na przemieszczaniu się gospodarzy. Mogą przylgnąć do zwierząt, takich jak żółwie i ryby.
Heliozoans: Wiadomo, że Heliozoans żyją w słodkich wodach, takich jak jeziora, a nie oceany. Charakteryzują się brakiem szkieletu i sztywnych nóg pałeczek amebokich.
Inne protisty obejmują ameby i radiolary.
