Udomowione rasy koni mają 64 chromosomy. Koń Przewalskiego, jedyna znana rasa dzikiego konia, ma 66 chromosomów. Pomimo tej różnicy obie rasy koni są w stanie połączyć się w pary i produkować płodne potomstwo.
Zmapowany w 2007 roku przez Horse Genome Project, materiał genetyczny konia zawiera 2,7 miliarda par zasad DNA w każdym chromosomie. Inne zwierzęta z 64 chromosomami to szynszyla, lis fenek i skunks cętkowany. Osły, które mają 62 chromosomy, są hodowane z udomowionym koniem w celu wytworzenia mułów, które mają 63 chromosomy. Z powodu tej liczby nieparzystej większość mułów jest niepłodny.
