Atom wodoru ma jeden proton, jeden elektron i nie ma neutronów. Ten atom wodoru jest również nazywany protium, który jest również izotopem. Liczba atomowa tego elementu gazowego wynosi 1, a jego masa atomowa wynosi 1,00794 gramów na mol.
Ponad 90 procent wszechświata składa się z wodoru. Wodór pełni ważną funkcję w syntezie jądrowej. Wodór jest również potrzebny wielu gwiazdom, takim jak słońce jako źródło energii.
Chociaż prot jest jednym izotopem, dwa inne izotopy wodoru to deuter i tryt. Deuter ma jedną neutron i taką samą liczbę elektronów i protonów, która jest jedna. Tryt ma dwa neutrony i po jednym z protonów i elektronów. Tryt jest radioaktywnym izotopem o okresie półtrwania wynoszącym 12 1/2 lat.