Wydry morskie chronią się przed drapieżnikami, uciekając na suchy ląd, ukrywając się w kelp lub płynąc. Głównymi drapieżnikami wydr morskich są rekiny i wieloryby zabijające wodę, dzięki czemu wydry morskie mogą się chronić wspinając się na ląd.
Choć wydry morskie muszą chronić się przed drapieżnikami morskimi, muszą także uważać na drapieżniki lądowe. Kojoty i niedźwiedzie są znanymi drapieżnikami ziemi wydr morskich. Jeśli wydry nie uciekną do wody przed tymi drapieżnikami, muszą użyć swoich mocnych zębów jako wysiłku ostatniego rzutu.
Wydry morskie nie tylko potrzebują ochrony przed drapieżnikami, ale także przed własnym środowiskiem. Ich naturalną skłonnością jest spędzanie dużej ilości czasu w zimnej wodzie. Tam, gdzie niektóre ssaki morskie używają grubej warstwy tłuszczu do utrzymania ciepła, wydry morskie zaizolują się grubą warstwą futra. Każdy cal kwadratowy skóry wydry morskiej jest pokryty około milionem włosów. Te gęste włosy zapobiegają przedostawaniu się wody do skóry i działają jak wodoodporny płaszcz.
Wydry morskie są również wtajemniczone w kłusownictwo i choroby. Na przykład w połowie lat 90. choroba zagroziła wyludnieniem populacji wydry morskiej w Kalifornii. Kłusowanie na futro zwierzęcia miało poważny wpływ na populację wydr morskich.
