Rośliny narażone na kwaśne deszcze mogą zostać uszkodzone, co sprawia, że są podatne na choroby, a także utrudniają ich wzrost, nawet do momentu śmierci w małych roślinach. Kwaśne deszcze są wynikiem powietrza zanieczyszczenia, gdy poziom dwutlenku siarki lub tlenku azotu wzrośnie zbyt wysoko i obniży poziom PH deszczu.
Gdy kwaśne deszcze wchodzą w kontakt z liśćmi, mogą usuwać ochronne warstwy wosku, które zapobiegają infekcjom bakterii i wirusów oraz utrzymują nienaruszoną integralność strukturalną roślin. Nawet jeśli deszcz nie uszkodzi ich bezpośrednio, pozostawia je otwartymi na uszkodzenia lub zniszczenie przez pogodę, naturę lub owady. Wtórnym efektem kwaśnego deszczu jest jego wymywanie do gleby. Kwaśna gleba nie może skutecznie dostarczać składników odżywczych, co może powstrzymać rośliny przed ich uprawą lub całkowicie je zabić, jeśli nie ma wystarczających ilości składników odżywczych.