Jaguary mają kilka adaptacji, aby zapewnić im przetrwanie, a jednym z najbardziej zauważalnych jest ich nakrapiane płaszcze. Inną adaptacją jest umiejętność pływania w obszarach o dużym natężeniu deszczu.
Większość jaguarów ma pomarańczowo-brązowe futro z ciemnymi plamami, ale niektórzy mają czarno-czarny płaszcz, który pomaga im ukryć się przed ofiarą, dopóki nie będą gotowi do skoku. Płaszcz z plamami jaguara działa jak kamuflaż w bagnach i lasach deszczowych. To zwierzę ma unikalny typ miejsca zwanego rozetą. W przeciwieństwie do innych rodzajów plam, rozeta ma mniejsze plamki na środku.
Jaguary są również doskonałymi pływakami, które pomagają im przystosować się do mokradeł i innych obszarów z dużą ilością wody. Zdolność pływania jaguara ułatwia łapanie jedzenia lub ochłodzenie w upalne dni.
Jaguary mają duże, mocne szczęki i doskonałe widzenie w nocy. Ich silne szczęki pomagają im przebijać czaszki ofiary. Ponieważ jaguary często zabijają swoją zdobycz jednym ugryzieniem w tył głowy, nazywa się je "potłuczkami potylicznymi".
Dobre nocne widzenie jest koniecznością dla jaguarów żyjących w ciemnych lasach. Ich siatkówki mają specjalną warstwę odblaskową i składają się z wielu komórek prętowych. Jaguary mają także dużych uczniów. Wszystkie te cechy ułatwiają jaguarom polowanie w nocy i zobaczenie ich ofiary w ciemnych obszarach łowieckich.