Naukowcy nie są pewni dokładnych ruchów ciała związanych z kopulacją stegozaurów, ponieważ nie ma dostępnych współczesnych przykładów; mają jednak kilka teorii opartych na żyjących potomkach dinozaurów. Z pewnością samczyk nie umieścił samicy jak większość gatunków zwierząt. Zamiast tego możliwe jest, że kładą się na brzuchu lub żeńska kładzie się, podczas gdy samiec stoi obok niej. Naukowcy sugerują nawet, że mogli stanąć ramię w ramię.
Wiadomo, że dinozaury, w tym stegozaur, składają jaja. Z biologicznego punktu widzenia czas niezbędny do rozmnażania był minimalny, chociaż w przeciwieństwie do ryb musieli mieć rzeczywistą fizyczną intymność. Zamiast tego, podobnie jak współczesne ptaki, możliwe jest, że niewielka ilość spermy zdeponowana w samicy może zapładniać jaja przez kilka tygodni.
Ponieważ w tym czasie nie znaleziono żadnych zachowanych tkanek miękkich ani odcisków tkanek miękkich od jakichkolwiek dinozaurów, nie można dowiedzieć się, jak te bardzo kościste, kłujące stworzenia zostały odtworzone. Podobnie jak współczesne jeżozwierze i jeże, jest oczywiste, że rozmnażały się przez tysiące lat. Natura zawsze znajduje sposób, i możliwe jest, że narządy płciowe dla mężczyzn i kobiet zostały specjalnie ukształtowane, aby proces mógł odbywać się bez większych trudności.
