Królewskie kolonie rządzone były przez angielską monarchię przez królewskiego gubernatora wyznaczonego przez monarchię oraz radę królewską. Gubernatorowi i radzie towarzyszyły niższe rady, które nadzorowali.
Wiele królewskich kolonii nie zaczęło się w ten sposób rządzonych. Zamiast tego często były własnością lub spółkami joint venture nadanymi przez angielską monarchię. Kiedy jednak te karty osiągnęły swój limit czasu lub zostały odwołane przez monarchię, kolonie przekształcono w królewskie kolonie. Koloniści obawiali się niestabilności tego, w jaki sposób zostali rządzeni, ponieważ gubernatorzy mogli zmienić lub nawet zostać zdetronizowani przez kolonistów, zanim przekształcenie w królewskie kolonie przyniosło jeszcze więcej zmian.
Gubernator królewskiej kolonii został mianowany przez króla i spełnił życzenia króla, a nie życzenia gubernatora. Królewskie instrukcje przyjmowały dwie formy: ogólną komisję, która po głośnym przeczytaniu gubernatora była w zasadzie wiedzą publiczną i specjalnymi instrukcjami, które zazwyczaj były czytane tylko przez samego gubernatora.
W koloniach gubernator był najwyższą władzą sądowniczą, zachęcaną przez monarchię do wykorzystywania swoich uprawnień weta, by w miarę możliwości rozwijać brytyjskie interesy. Gubernator, jego rada królewska i inni oficjalni członkowie rządu kolonii królewskiej byli zazwyczaj wybierani ze względu na ich powiązania społeczne i polityczne, a nie doświadczenie i zdolność rządzące innymi.