Podstawową funkcją pręta mieszającego jest ręczne mieszanie roztworów. Mieszanie prętów ma inne zastosowania w laboratorium, w tym pomaga w dekantacji cieczy z pojemników, rozbijaniu emulsji i indukowaniu krystalizacji.
Mieszadła są używane do powolnego zlewania lub wlewania płynów. Powolne nalewanie jest niezbędne podczas pracy z potencjalnie niebezpiecznymi substancjami chemicznymi, które mogą reagować zbyt szybko. Korzystanie z pręta mieszającego do dekantacji cieczy ułatwia utrzymanie osadu na dnie zlewki, ponieważ ciecz leje wolniej, zmniejszając prawdopodobieństwo jej wzburzenia.
W celu wywołania krystalizacji w eksperymencie rekrystalizacji szklany pręt mieszający ociera się o wnętrze kolby zawierającej roztwór.