Kwaśny deszcz zanieczyszcza wodę i glebę, zabijając mikroby, owady, ryby i inne dzikie gatunki wodne i roślinność. Koroduje kamień i metal, a także niszczy lakier samochodowy. Chociaż kontakt z kwaśnym deszczem nie jest bezpośrednio szkodliwy dla ludzi, może pośrednio powodować problemy zdrowotne.
Alkaliczna gleba zmniejsza działanie kwaśnych deszczy. Jeśli padnie na inne rodzaje gleby, zmienia kwasowość gleby i zabija żyjące w ziemi mikroby i owady. Kwaśne deszcze i śnieg w jeziorach i rzekach mogą obniżyć poziom pH wody, przez co staje się zbyt kwaśny, aby utrzymać życie w wodzie. Chociaż nie zabija bezpośrednio roślinności, kwaśne deszcze wypłukują składniki odżywcze z gleby, pozostawiając elementy takie jak aluminium, które zmieniają toksyczność gleby. Zniszczenie gleby prowadzi do zahamowania wzrostu roślin, a rośliny mogą w końcu umrzeć, ponieważ gleba nie ma składników odżywczych potrzebnych do wzrostu i zwalczania chorób.
Drzewa na dużych wysokościach są szczególnie wrażliwe, ponieważ otrzymują więcej śniegu i deszczu, a chmury i kwaśne chmury często je otaczają. Kwaśne deszcze przyspieszają naturalne wietrzenie kamienia, korodują metal i trawią znaki na farbie pojazdu. Chociaż kwaśne deszcze nie mogą spalić skóry ani oczu osoby, może to spowodować problemy z oddychaniem i sercem, poprzez osadzanie cząstek siarczanu i azotanu na poziomie gruntu. Powoduje smog, który osłabia i drażni układ oddechowy.
