Protiści służą wielu celom w ekosystemie, w tym wytwarzają od 70 do 80 procent światowego tlenu, będąc głównym źródłem pożywienia dla zwierząt wodnych i głównym rozkładającym się składnikiem martwego materiału. Protisty mogą mierzyć się do 300 stóp długości, jak w przypadku olbrzymich wodorostów lasów kelp na Pacyfiku.
Protiści również odgrywają rolę w ekosystemie ze względu na ich rolę w chorobach. Niektóre z chorób, z którymi się kojarzą, obejmują malarię i śpiączkę. Protisty można również wykorzystywać do tworzenia szczepionek na te same choroby. Istnieją również prostsze codzienne zastosowania dla protistów, w tym zagęszczacze do zup, filtry i produkty do polerowania.
