Organelle, które zawiera większość enzymów hydrolitycznych w komórce, to lizosom. Lizosomy są względnie małymi organellami związanymi z błoną, które komórki wykorzystują do różnych celów, w tym do rozbijania cząsteczek organicznych, walki organizmy, które powodują choroby i naprawiają błony komórkowe.
Lizosomy są niezbędne do trawienia w komórce i wykorzystują ich enzymy do rozbijania artykułów spożywczych na formy, z których może korzystać komórka. Jeśli w środowisku nie ma wystarczającej ilości pożywienia, lizosomy są zdolne do rozkładania innych organelli na niezbędne materiały. Gdy są używane do obrony, lizosomy mogą niszczyć patogeny atakujące komórkę lub, u zwierząt, mogą być stosowane przez wyspecjalizowane komórki odpornościowe w celu niszczenia patogenów, które zagrażają różnym komórkom. Komórki te pochłaniają patogeny i uwalniają na nie enzymy hydrolityczne w obrębie lizosomów.
Enzymy w lizosomach są niebezpieczne dla komórki, która je wytwarza. Gdyby błona lizosomu miała przeciekać, mogłaby strawić samą komórkę. Ta błona składa się z lipidów, a zawarte w niej enzymy są białkami. Lizosomy są zwykle spotykane tylko w komórkach zwierzęcych lub zwierzęcych. Komórki roślinne na ogół nie mają lizosomów, ponieważ ich ściany komórkowe chronią je przed niebezpieczeństwami, z którymi zwykle walczą lizosomy.
