Dwa aminokwasy w białku są połączone przez wiązanie peptydowe lub wiązanie amidowe. Aminokwasy są związane przez grupę alfa-karboksylową jednego z grupą alfa-aminową drugiego . Białka składają się z szeregu wiązań peptydowych połączonych ze sobą w celu utworzenia liniowych łańcuchów polipeptydowych.
Kiedy dwa aminokwasy są połączone w wiązanie peptydowe, reakcja powoduje utratę jednej cząsteczki wody. Łańcuch polipeptydowy jest polarny, ponieważ ma różne końce, z grupą alfa-karboksylową na jednym końcu i grupą alfa-aminową na drugim. Białka składają się z łańcucha polipeptydowego od 50 do 2000 aminokwasów, połączonego wiązaniami peptydowymi.