Niektóre rośliny znalezione na Oceanie Indyjskim to gatunki drzew mangrowych w lasach namorzynowych Madagaskaru, przybrzeżna trawa morska w Indiach i makroalgi Zachodniej Australii. Ocean Indyjski obejmuje różnorodne biologicznie zróżnicowane regiony ekologiczne, w tym wschodniego wybrzeża Afryki, zachodniej Australii i południowych wybrzeży Azji.
Duża wyspa położona w południowo-wschodniej Afryce, Madagaskar jest całkowicie otoczona przez Ocean Indyjski i jest rośliną przybrzeżną należącą do najbardziej zróżnicowanych na świecie. Drzewa mangrowe rosną wzdłuż regionów międzypływowych i mogą być identyfikowane przez korzenie, które przeplatają się w wodach pływowych na szerokościach geograficznych położonych najbliżej równika na północy.
Indyjskie lasy namorzynowe są obfite w całym lesie Sundarbans, w pobliżu południowo-zachodnich wybrzeży kraju i wokół Zatoki Bengalskiej. Piaski, które gromadzą się wokół ujść rzeki przez zatokę, mogą w końcu utworzyć się w wydmach podczas sztormów monsunowych, aby uprawiać złoże traw morskich, które dodatkowo rośnie na łąkach lagunowych w Zatoce Mannar i Wysp Lakshadweep.
Stan Australii Zachodniej obejmuje również populacje trawy morskiej wokół wód przybrzeżnych rozciągających się na Oceanie Indyjskim. Poza trawą morską, jej flora wodna składa się z różnych gatunków alg, takich jak czerwone algi morskie, zielone algi morskie i brązowe algi, z których wszystkie pochodzą z australijskich ekosystemów.