Indianie Cherokee mają rysy twarzy podobne do innych Indian amerykańskich, które obejmują wysokie kości policzkowe, oczy w kształcie migdałów, ciężkie powieki, duże zęby przednie, ciężkie płatki uszu i brązową skórę. Jednak nie wszystkie Cherokee posiadają te cechy fizyczne, ze względu na wczesny kontakt ze szkockimi i niemieckimi górnikami na południowym wschodzie.
Niektóre Cherokee mogą być blond, niebieskie oczy i jasnoskóre. Cherokee mężczyzn są zazwyczaj między 5 stóp 4 cali i 5 stóp 5 cali wysokości, kobiety zwykle są krótsze niż 6 cali. Co ciekawe, Cherokee mogą uzyskać niektóre z ich cech fizycznych od ludów Bliskiego Wschodu, ponieważ ich DNA ma ślady podobieństwa do Egipcjan, Turków, Libańczyków, Hebrajczyków i Mezopotamii.
