W porządku chronologicznym, cztery etapy oddychania komórkowego to glikoliza, reakcja przejściowa, cykl Krebsa i łańcuch transportu elektronów. Oddychanie komórkowe zachodzi w cytoplazmie i mitochondriach.
Glikemia występuje w cytoplazmie i pozwala jednej cząsteczce glukozy rozdzielić się na dwie cząsteczki kwasu pirogronowego. Następnie reakcja przejściowa przenosi kwas pirogronowy do mitochondriów, gdzie przekształca się w acetylokoenzym A. Następnie cykl Krebsa występuje w mitochondriach i wytwarza cztery cząsteczki trifosforanu amonu i liczne cząsteczki zredukowanego dinukleotydu nikotynoamidoadeninowego. W końcu łańcuch transportu elektronów w mitochondriach wytwarza około 32 cząsteczek ATP i kończy proces oddychania komórkowego. W sumie około 38 cząsteczek ATP jest wytwarzanych dla każdej cząsteczki glukozy.