Wśród wielu drapieżników czarno-ogonowych psów preriowych są kojoty, bobaty, borsuki, szybkie lisy, złote orły, jastrząbki, jastrzębie i grzechotniki. Rzadkie fretki o czarnych nogach, grzebiące sowy i niektóre gatunki węży zstępują w dziury na prerii z czarnymi ogonami, aby je polować.
Ze względu na obfitość drapieżników, psy preriowe mają stanowiska odsłuchowe w pobliżu wyjść z ich skomplikowanych podziemnych labiryntów. Mają specjalny sygnał przypominający ćwierkanie, które sygnalizuje, że niebezpieczeństwo jest bliskie. Jeden pies preryjny robi pierwsze ostrzeżenie, a inni go podejmują. Kiedy niebezpieczeństwo minęło i można bezpiecznie wyjść, jednostka brzmi jasno, inni ją powtarzają, a wkrótce całe miasto rwie i tańczy.
Ogoniaste psy preriowe żyją w społecznościach zwanych miastami, które zazwyczaj obejmują milę kwadratową i zawierają kilkaset osobników. Jednak największe znane miasto rozciągało się na ponad 25 000 mil kwadratowych, a jego populacja szacowana była na 400 milionów. Na niektórych obszarach psy preriowe uważane są za gatunek kluczowy, wnosząc istotny wkład w dobre samopoczucie lokalnej flory i fauny. W ranchlands są one jednak uważane za szkodniki i są eksterminowane. Oprócz drapieżników i ludzi kolejnym niebezpieczeństwem dla psów preriowych jest choroba, która czasami roszcza całe kolonie. Chociaż okresowo podejmowane są próby wymienienia czarnogłowego preryjnego psa jako zagrożonego lub zagrożonego gatunku, chociaż w 2009 r. Amerykańska Organizacja ds. Rybołówstwa i Ochrony Przyrody uznała, że ochrona nie była uzasadniona.
