Od czasu do czasu szopy i wielkie sowy rogate stanowią zagrożenie dla orłów w gnieździe. Jednakże, z powodu ich dużych rozmiarów i silnej zdolności do drapieżnictwa, łyse orły nie są regularną zdobyczą dla żadnego gatunku.
Mimo, że są rzadko żerowane na wolności, łyse orły były w przeszłości zagrożone działalnością człowieka. Na przykład, orły są na szczycie łańcucha pokarmowego, więc są bardzo podatne na działanie toksycznych chemikaliów w środowisku; każdy krok w górę łańcucha pokarmowego ma tendencję do koncentrowania toksyn u gatunków drapieżnych. Dichlorodifenylotrichloroetan, trujący pestycyd powszechnie stosowany w Stanach Zjednoczonych od lat czterdziestych, niemal doprowadził bielika do wyginięcia. W 1963 roku populacja bielik został zredukowana do 487 par gniazdujących. Na szczęście jednak DDT został zakazany w Stanach Zjednoczonych w 1972 r., A do 2007 r. Było około 9 779 par gniazdujących w sąsiadujących Stanach Zjednoczonych.
