Gekony mają wiele naturalnych drapieżników, z których głównymi są węże. Duże pająki, ptaki i inne ssaki również jedzą gekony.
W obliczu potencjalnego drapieżnika wiele gekonów może stracić ogon. Samo-amputacja lub autonomia pomaga uciekać gekonowi, ponieważ oderwany ogon wije się i rozprasza drapieżnika, pozwalając uciekać gekonowi. W większości przypadków gekon wyhoduje zastępczy ogon wykonany z chrząstki. Po ustaniu niebezpieczeństwa gekon często powraca na swój oderwany ogon i jeśli jest dostępny, gekon go zje. Gekony mogą również uciec przed drapieżnikami za pomocą swoich ochraniaczy palców, które są zaprojektowane do płynnego wspinania się po pionowych powierzchniach.