Anton Van Leeuwenhoek, znany jako ojciec mikrobiologii, był pierwszym, który zaobserwował bakterie w 1676 roku. Użył jednego z pierwszych mikroskopów złożonych i znalazł coś, co nazwał "wyćwiczonymi bestiami" w wodzie stawowej .
Anton van Leeuwenhoek wykorzystał technologię mikroskopu do badania procesu reprodukcji. Był pierwszym, który zaobserwował zarówno spermę jak i jaja kilku gatunków. Podczas gdy Anton van Leeuwenhoek był pierwszym, który zaobserwował żywe organizmy jednokomórkowe, zwane mikroorganizmami, nie był pierwszym, który obserwował komórki. Robert Hooke po raz pierwszy obejrzał komórki, oglądając plasterki korka pod mikroskopem złożonym w 1663 roku. Zobaczył powtarzające się struktury z wyglądem komórek więziennych, w wyniku czego nazwał struktury "komórkami".