Współczesna krótkowłosa chihuahua pochodzi z Chihuahua w Meksyku w latach 50. XIX wieku. Starożytne pochodzenie rasy jest dyskutowane, ale historycy uważają, że Chihuahua zostały po raz pierwszy odkryte w Meksyku, Ameryce Środkowej lub Ameryce Południowej.
Jedna z teorii sugeruje, że Chihuahua pochodzą od południowoamerykańskiego psa Techichi, który został przedstawiony w rzeźbach Tolteków z IX wieku. Ilustracje Techichi przedstawiają cechy podobne do Chihuahua, w tym ich okrągłe głowy i duże uszy. Populacja Techichi została zasymilowana w kulturze Azteków po zdobyciu Tolteków, ale stopniowo zanikła podczas hiszpańskiego podboju. Aztekowie wierzyli, że psy Techichi były jasnowidzącymi przewodnikami świata podziemnego i chwalili je jako symbole mistycyzmu i uzdrawiania.