Jądro nukleotomu składa się z lewoskrętnej podwójnej helisy DNA owiniętej wokół rdzeniowych białek zwanych histonami. Nukleosomy są podstawową jednostką pakowania DNA używaną do przechowywania informacji genetycznej w jądrze komórki eukariotycznej.
W jądrze komórek eukariotycznych genom organizmu jest zawarty w chromosomach organizmu. Chromosomy składają się z powtarzających się jednostek nazywanych nukleosomami. Każdy nukleosom składa się ze 147 par zasad DNA ułożonych w lewoskrętną podwójną helisę. Nić DNA wieje wokół białka oktomeru histonowego. Każda cząstka rdzenia nukleosomu jest oddzielona około 80 parami zasad DNA linkera.
Białko histonowe składa się z ośmiu białek. Istnieją dwie kopie każdego z czterech białek histonowych: Histone 2A, Histone 2B, Histone 3 i Histone 4. Histon 1 istnieje jako białko linkera histonowego i jest związany z wejściem DNA i wiązaniem wyjściowym do DNA linkera. Histon 1 służy do wiązania nukleosomów w celu dalszego skrócenia chromatyny. Ogonki białek histonowych wystają i są dostępne do modyfikacji przez różne enzymy modyfikujące histony jako sygnały do transkrypcji, replikacji i funkcji naprawy DNA. Metylacja, acetylacja i fosforylacja są najczęstszymi rodzajami modyfikacji.
