Rasa, z którą miesza się Chihuahua, jest nieznana. Istnieje wiele pomysłów na temat pochodzenia rasy, ale nie ma dowodów, że jakiekolwiek są prawdziwe.
Niektórzy uważają, że rasa pochodzi z południowo-środkowoamerykańskiego regionu i została opracowana przez hodowlę psa Techichi. Inni uważają, że Chihuahua pochodzi z Chin i został przywieziony do Stanów Zjednoczonych, gdzie hodowano go z mniejszymi rodowitymi psami. Jeszcze inni uważają, że rasa pochodzi od lisów Fennec, pochodzących z Republiki Południowej Afryki.
Nawet z dowodami, że Chihuahua istnieją już od czasów starożytnych, mówi się, że pochodzą z Meksyku i są nazwane stanem Chihuahua w tym kraju.
