Zakres zmiennych, w tym dieta, zużycie wody i funkcja nerek, a także ogólna kondycja, określa zapach moczu. Zdrowy ludzki mocz zwykle nie ma silnego zapachu. Czasem wydzielany przez mocz zapach amoniaku jest możliwym objawem odwodnienia lub choroby.
Zdrowe moczy to 95 procent wody i 5 procent kwasu moczowego i innych odpadów metabolicznych. To 5 procent daje moczowi charakterystyczny zapach. Kiedy osoba jest odwodniona, jego mocz staje się bardziej skoncentrowany, a ilość kwasu moczowego i odpadów w strumieniu wzrasta. Diabetycy mogą mieć mocz, który pachnie słodko, ponieważ organizm wydala nadmiar cukru jako produkt odpadowy.
Inne stany, takie jak infekcje dróg moczowych, choroby przenoszone drogą płciową i problemy z nerkami, mogą również wpływać na zapach moczu; jednak zdarza się, że zdrowi ludzie zauważają zmianę w zapachu moczu. Dieta bogata w białka może powodować, że mocz ma silniejszy zapach, ponieważ organizm naturalnie wytwarza amoniak, gdy metabolizuje białko. Dodatkowo, produkty spożywcze, takie jak szparagi, czosnek, cebula, tuńczyk i kawa zawierają związek siarki zwany merkaptanem metylu, który, po rozbiciu, wytwarza ostry zapach. Metylomerkaptan jest źródłem charakterystycznego zapachu skunksa.