Izolowana kolonia jest kolonią bakteryjną, która została wyizolowana z innych zanieczyszczeń, zwykle przez umieszczenie próbki na sterylnym naczyniu Petriego lub szklanym szkiełku z odżywkami. Ten proces zapewnia, że wszelkie obserwacje lub eksperymenty są bezpłatne z zewnątrz zanieczyszczeń biologicznych. Ta kolonia jest często nazywana "czystą kulturą".
Ponieważ najczystsza hodowla pochodzi z pojedynczej komórki, biolodzy mogą bardzo się starać, aby stworzyć izolowane kolonie. Pierwsza kultura jest uważana za zanieczyszczoną. Jest rozproszony na pożywce, często po prostu przesuwając ją przez szkiełko lub naczynie. Jeśli zostanie to zrobione poprawnie, zapewni to, że dzielące się komórki utworzą małe izolowane kolonie, które następnie można przenieść do innego slajdu jako czystej kultury. Inna metoda tworzenia czystych kultur polega na rozpuszczaniu próbek bakterii w wodzie, a następnie za pomocą mikroskopu w celu zlokalizowania kropli z pojedynczą wyizolowaną bakterią. Bakteria ta jest następnie umieszczana w roztworze odżywki wodnej w celu utworzenia kolonii.
Po opracowaniu wyizolowanej kolonii można ją wykorzystać do wielu celów. W laboratoriach medycznych izolowane kolonie są często używane do identyfikowania i diagnozowania choroby, badania jakości próbki komórek nowotworowych lub określania, które antybiotyki są najskuteczniejsze w zwalczaniu bakterii. Laboratoria genetyczne wykorzystują te próbki do eksperymentowania z rekombinowanym DNA lub do wyszukiwania określonych genów.
