Ogromna większość komórek prokariotycznych ma ściany komórkowe. W bakteriach są one zbudowane z peptydoglikanu, podczas gdy archaea używają innych materiałów do budowy ścian komórkowych, takich jak białko lub pseudomektyna. Jedyną grupą prokariontów, którym w naturalny sposób brakuje ścian komórkowych, znane są jako bakterie mykoplazmatyczne.
Ściana komórkowa zapobiega przedostawaniu się wody do komórki bakteryjnej, pompując ją i powodując pęknięcie błony komórkowej. W ten sposób wiele antybiotyków atakuje bakterie. Antybiotyki wprowadzają związki chemiczne, które zakłócają tworzenie ścian komórkowych peptydoglikanu. Bakterie muszą tworzyć nowe ściany komórkowe, gdy rozmnażają się przez rozszczepienie binarne.
