Woda destylowana ma tendencję do testowania między 7,0 a 6,8 w skali pH, ponieważ woda wystawiona na działanie otwartego powietrza pochłania dwutlenek węgla i staje się bardziej kwaśna.
Woda destylowana jest często narażona na działanie dwutlenku węgla w powietrzu w pewnym momencie procesu destylacji. Czysta woda ma wartość 7,0 i jest całkowicie obojętna, ale źródła wody destylowanej mogą osiągnąć nawet 5,5 w skali pH. Ten poziom kwasowości nie jest generalnie zagrożeniem, ale może rozpuścić lekkie metale, takie jak miedź. Dlatego miedź nie jest dobrym materiałem do transportu wody przez rury; jeżeli do transportu wody wykorzystywany jest lekki metal, jeżeli woda stanie się jeszcze tak kwaśna jak pH 5,5, kawałki miedzi mogą zostać rozpuszczone w wodzie, stając się jej częścią. Konsumenci mogą następnie wypić wodę i zatruć metal, co może być śmiertelne. Woda destylowana o doskonałej wartości pH 7,0 jest ogólnie trudna do osiągnięcia, a w większości przypadków musi być wykonana w laboratorium. Według lekarzy takich jak Andrew Weil, woda destylowana jest na ogół tak blisko neutralnego pH, jak ludzie mogą uzyskać, i jest całkowicie bezpieczne picie.