Wodorosty nie należą do jednego królestwa, ale do kilku różnych z powodu różnych procesów ewolucyjnych. Te królestwa to Kingdom Plantae, Kingdom Chromista i Kingdom Bacteria.
Istnieją trzy rodzaje wodorostów, które można odróżnić od koloru plechy. Wodorosty w typie Ochrophyta są brązowe, w typie Rhodophyta są czerwone, a te w typie Chlorophyta są zielone. Oprócz koloru, te trzy grupy mają znaczne różnice w ich strukturach i składach biochemicznych, takich jak ściany komórkowe, wici, związki magazynujące, chloroplasty, barwniki fotosyntetyczne, mitoza i połączenia komórkowe. Do tej pory odkryto około 11,500 gatunków wodorostów.
