Proton jest około 2000 razy cięższy od elektronu. Protony i elektrony wraz z neutronami są głównymi cząstkami subatomowymi, które składają się na atom.
Protony i elektrony mają równe, lecz przeciwne ładunki. W większości przypadków atomy mają taką samą liczbę protonów i elektronów. Ponieważ jednak protony są o wiele cięższe od elektronów, elektrony nie wnoszą znaczącego wkładu w masę atomu. Masy atomów są wyrażone we względnych jednostkach masy zwanych atomowymi jednostkami masy lub a.m.u. Protony mają masę 1,007277 a.m.u., a elektrony mają masę 0,00054858 a.m.u.
