Samica aligatora zwykle składa się z 35 do 50 jaj jednocześnie według Instytutu Smithsona. Może jednak liczyć do 90 jaj.
Przed złożeniem jaj samica aligatora najpierw buduje gniazdo. Gniazdo ma średnicę do 10 stóp i wysokość 3 stóp. Pod koniec czerwca i na początku lipca samice aligatora składają jaja, które następnie inkubują przez około 65 dni. Temperatura inkubacji określa, czy potomstwo będzie płci męskiej czy żeńskiej z temperaturami powyżej 93 stopni Celsjusza, w wyniku czego wszystkie samce.
Przed wylęgami potomstwa zaczynają wydawać odgłosy w jajach. Matka usunie następnie materiały do zagnieżdżania. Po urodzeniu około 80 procent młodych aligatorów umiera z powodu drapieżników, takich jak ptaki.
