Wiązanie dipeptydowe powstaje w wyniku reakcji kondensacji między końcową grupą aminową a końcową grupą kwasu karboksylowego dwóch różnych aminokwasów. Istnieje wiele różnych rodzajów dipeptydów, które są nazwane na podstawie na składnikach aminokwasów.
W wyniku wiązania dipeptydowego tworzy się woda. Różne dipeptydy mają różne właściwości, które są używane przez komórki. Właściwości są oparte na właściwościach poszczególnych aminokwasów. W niektórych przypadkach, podobnie jak w przypadku alaniny i glicyny, niektóre właściwości rosną wykładniczo, podobnie jak rozpuszczalność. Najczęstsze funkcje dipeptydów mają pomóc w regulacji poziomu pH w komórce lub działać jako przeciwutleniacze.
