Różne rodzaje bakterii wykorzystują różne mechanizmy do nawigacji w swoich środowiskach. Te metody poruszania obejmują stosowanie przydatków, takich jak wici i pilki, przy użyciu napędu chemicznego i łączenia innych bakterii jako części biofilmu.
Wić jest biczowym ogonem używanym przez niektóre bakterie. Jego ruch podobny do śmigła pozwala pływać bakterii naprzód. Pilli to podobne do włosów wyrostki pokrywające powierzchnię bakterii. Pilli chwyta powierzchnie i pomaga bakteriom w poruszaniu się po nich.
Bakterie, które używają chemikaliów do poruszania się, robią to na dwa sposoby: wydalanie śluzu i stosowanie chemotaksji. Szlam bakteryjny wspomaga przepływ bakterii do przodu, podczas gdy chemotaksja wykorzystuje chemiczne sygnały w środowisku, aby biernie iść naprzód. Kiedy bakterie wykorzystują chemotaksję, są przyciągane do konkretnej substancji chemicznej, której potrzebują. Kiedy sygnał chemiczny nie jest już obecny, bakterie przestają się poruszać.
Biofilmy to duże skupiska bakterii, które produkują cienki film. Bakterie tworzące biofilm poruszają się razem w określonym układzie, zachowując integralność filmu. Niektóre biofilmy pozostają nieruchome, przyklejają się do obiektów, a nie poruszają się jako grupa. Biofilmy są również zaangażowane w bakteryjne choroby ludzi, takie jak płytki nazębne i choroby dziąseł, infekcje dróg moczowych i infekcje serca.