Chromatografia służy do badania pigmentu roślinnego poprzez ekstrakcję pigmentów z rośliny, a następnie sortowania ich według ich właściwości fizycznych, aby można je było analizować. Chromatografia jest przydatna w oddzielaniu różnych rodzajów pigmentów roślinnych, ponieważ są one bardzo podobne do siebie i mogą być trudne do odróżnienia lub fizycznie oddzielić w inny sposób.
Chromatografia jest metodą, za pomocą której poszczególne elementy pojedynczej substancji lub przedmiotu są oddzielone od siebie, aby mogły być badane indywidualnie. Zadanie to jest często skomplikowane przez fakt, że pewne części komórki, takie jak pigment w komórkach roślinnych, mogą być trudne do różnicowania chemicznego. Aby oddzielić elementy substancji niegazowej, naukowcy zazwyczaj przekazują substancję przez mieszaninę roztworów. Wiele laboratoriów biochemicznych ma dziś maszynę zwaną chromatografem specjalnie do tego celu.
Gdy komórka roślinna przechodzi przez roztwór, różne pigmenty wiążą się z różnymi częściami roztworu. Kontrolując używane roztwory naukowcy mogą oddzielić pigmenty od siebie nawzajem, tworząc różne pierścienie koloru. Pierścienie te reprezentują inny rodzaj pigmentu w komórce roślinnej, a każdy z nich ma swoją własną charakterystykę fizyczną. Mimo że są one chemicznie podobne, oddzielają one pigmenty i umożliwiają biochemikom ich badanie.