Wysoka różnorodność biologiczna poprawia ekosystem, czyniąc go mniej podatnym na katastrofy i zwiększając tempo reprodukcji roślin. Wszystkie gatunki w ekosystemie polegają w pewnym stopniu na sobie nawzajem, a przy mniejszej bioróżnorodności ekosystem jest bardziej podatne na zwijanie.
Jako przykład znaczenia wysokiej bioróżnorodności, choroba kiedyś zniszczyła większość kasztanowców ze wschodniej Ameryki Północnej, ale ekosystemy przebiły się, ponieważ inne drzewa nie zostały dotknięte chorobą. Na obszarze o mniejszej różnorodności biologicznej taka choroba mogła spowodować masową utratę siedlisk, prowadząc do potencjalnego wypierania i wymierania gatunków.
Wysoka różnorodność genetyczna, będąca innym rodzajem różnorodności biologicznej, wpływa na ekosystemy poprzez poprawę zdrowia potomstwa. Gatunki, które nie są genetycznie zróżnicowane, są bardziej podatne na wymarcie w wyniku podatności na choroby i wady wrodzone. Gatunek jest najzdrowszy, gdy kwitnie kilka populacji.
Wyginięcie w wyniku braku różnorodności biologicznej może mieć znaczący negatywny wpływ na ekosystem, zwłaszcza jeśli ekosystem ten ma już niską różnorodność biologiczną. Jeśli w ekosystemie nie ma innych gatunków, które mogłyby wypełnić rolę wymarłego gatunku, cały ekosystem jest zagrożony upadkiem. Ponieważ gatunki w ekosystemie polegają na sobie nawzajem, jedno wymarcie może z łatwością doprowadzić do innego.