Funkcja mikropyle różni się nieznacznie w zależności od tego, czy jest używana w botani- ce czy zoologii. W botanice mikropyle odnosi się do dowolnego otworu w zewnętrznej warstwie owulki. To otwarcie umożliwia nawożenie rośliny pyłkiem. W zoologii jest to por w błonie komórkowej jajnika.
Mikropyl w błonie komórkowej jajnika pozwala na przedostanie się plemników do komórki jajowej. Zarówno w przypadku roślin, jak i zwierząt mikropył służy jako otwór umożliwiający wprowadzanie środka do zapładniania i wchodzenie w interakcję z jajem lub komórką jajową. Pochodzenie tego słowa można datować na lata 1815-1825 i ma swoje korzenie w języku greckim.
