Jednym z czynników wpływających na aktywność enzymów jest wartość pH. Jeśli występują małe zmiany pH, enzym ulegnie denaturacji, a aktywność katalityczna zostanie utracona.
Kolejnym czynnikiem jest temperatura. Reakcje katalizowane enzymem będą miały szybkość zwiększoną wraz ze wzrostem temperatury. Ponieważ enzymy są białkami, ulegają denaturacji i stają się nieaktywne w wyższych temperaturach.
Stężenie enzymu wpływa również na aktywność. Jeśli stężenie enzymu zwiększa się, gdy stężenie substratu utrzymuje się na stałym poziomie, szybkość reakcji podwoi się, gdy stężenie enzymu podwoi się. Wynika to z faktu, że stężenie molowe stosowanego enzymu prawie zawsze będzie niższe niż stężenie molowe substratu.