Zygota zawiera dwa zestawy chromosomów, po jednym z każdego rodzica. Dwie pary chromosomów sumują się do 46 całkowitych chromosomów u ludzi.
Zygota jest końcowym wynikiem połączenia dwóch komórek płciowych. Dzieje się to podczas zapłodnienia, gdy komórka nasienia od samca zapładnia jajo samicy. Każda komórka płeć zawiera 23 chromosomy. Chromosomy określają płeć potomstwa. Męska komórka seksualna zawiera X lub Y, podczas gdy komórka żeńska ma tylko chromosom X. Jeśli komórka męska zapładnia żeńską komórkę płciową chromosomem Y, potomstwo jest płci męskiej.
