Archaebakterie są naukowo sklasyfikowane w domenie Archaea. Termin "archaebakterie" pojawił się pod koniec lat 70. XX wieku, aby opisać nowo rozpoznaną trzecią domenę życia składającą się z niektórych drobnoustrojów. Ponieważ te organizmy są całkowicie odmienne od bakterii, naukowcy później zmienili nazwę tej domeny na Archaea.
Wiele mikroorganizmów Archean zamieszkuje ciężkie środowiska. Termofile żyją w ekstremalnych temperaturach, takich jak gorące źródła Parku Narodowego Yellowstone, jedno z pierwszych miejsc, w których odkryto Archaea. Halofile rozwijają się w silnie zasolonych wodach, podczas gdy metanogeny przeżywają pomimo wytwarzanego metanu.
Archaea nie żyją wyłącznie w ekstremalnych warunkach. Można je znaleźć na otwartym morzu wśród planktonu.
