Podstawową różnicą jest to, że skrobia jest przekształcana przez rośliny, podczas gdy glikogen jest przekształcany przez zwierzęta. Jednak zarówno skrobia, jak i glikogen są polisacharydowymi polimerami alfa glukozy.
Skrobia może być w postaci amylozy, z setkami pierścieni glukozy połączonych wiązaniami a-1,4 lub amylopektyną, która może zawierać tysiące pierścieni glukozy połączonych z kombinacją a-1,4 i -1,6 wiązania.
Glikogen jest środkiem, za pomocą którego zwierzęta przechowują glukozę do późniejszego użycia. Ma zarówno wiązania α-1,4, jak i α 1,6, takie jak amylopektyna, pozwalając na wiele gałęzi molekularnych, a w konsekwencji na większą powierzchnię dla szybszej konwersji przez hydrolizę z powrotem do glukozy.
