Niektóre negatywne aspekty diety niskotłuszczowej obejmują zachęcanie do spożywania szkodliwych pokarmów, podwyższanie poziomu trójglicerydów, unikanie zdrowej żywności i obniżanie poziomu cholesterolu HDL lub "dobrego" cholesterolu. Co więcej, diety o niskiej zawartości tłuszczu mogą obniżać poziom testosteronu i mogą prowadzić do chorób serca.
Chociaż producenci mogą mieć na myśli najlepsze intencje ludzi, nie można zaprzeczyć, że produkty z usuniętym tłuszczem nie smakują tak dobrze. Aby to zrekompensować, producenci często pakują te "niskotłuszczowe" produkty z cukrem. W rezultacie żywność oznaczona jako "o niskiej zawartości tłuszczu" może zawierać szkodliwą ilość cukru. Diety niskotłuszczowe również sprzyjają spożywaniu pełnoziarnistej pszenicy i oleju roślinnego. Cała pszenica, która zawiera gluten, powoduje u niektórych ludzi reakcję niepożądaną, podczas gdy oleje roślinne są w dłuższej perspektywie związane z zapaleniem i chorobami serca.
Wysokie poziomy trójglicerydów mogą również prowadzić do chorób serca. Diety niskotłuszczowe, zwykle zawierające dużo węglowodanów, często podnoszą poziom trójglicerydów. Ponieważ diety o niskiej zawartości tłuszczu mogą zawierać szkodliwe pokarmy, mogą również promować unikanie zdrowych, takich jak jaja, mięso i produkty mleczne, które są doskonałym źródłem niezbędnych witamin i minerałów. Jeśli chodzi o HDL lub "dobry" cholesterol, spożywanie tłuszczu może faktycznie podnieść te poziomy, podczas gdy badania wykazały, że dieta niskotłuszczowa je zmniejsza.
