Słona woda może mieć szkodliwy wpływ na wzrost roślin, utrudniając roślinie zdolność wchłaniania wody z powodu niekorzystnego ciśnienia osmotycznego wywołanego w systemie korzeniowym. Jest to zjawisko deficytu wody zasolenia i powoduje stan rośliny znany jako susza fizjologiczna. Nadmierna ilość soli wchodzącej do rośliny przez strumień transpiracji będzie również zmniejszać wzrost przez uszkadzanie komórek liścia w stanie określanym jako efekt zasolenia nadmiaru jonów.
Ogólnie rośliny mogą ulec uszkodzeniu, gdy ich liście lub korzenie zostaną wystawione na działanie wody zawierającej sól. Cząsteczki wody są ściśle związane z jonami soli. Utrudnia to roślinom wchłanianie wody. Gdy woda zawierająca sól dostanie się do gleby, jony sodu również przyczepiają się do cząstek gleby, powodując zagęszczanie gruntu i gęstnienie, zmniejszając zarówno drenaż, jak i napowietrzanie. Składnik chlorkowy może mobilizować metale ciężkie obecne w glebie i zmniejszać wigor roślin i ich wzrost.
Nadmierne ilości składników sodu i chloru w strefie korzeniowej mogą powodować niedobór fosforu i potasu. Chociaż rośliny wymagają tych mineralnych składników odżywczych, system korzeniowy może ominąć je na rzecz absorpcji jonów pochodzących z soli. Jony chlorkowe mogą również gromadzić się w toksycznych ilościach w roślinach i koncentrować się w aktywnie rosnących tkankach rośliny. Ten stan może spowodować obrażenia gałązek i oparzenia liści.
Ponieważ rośliny nie mają środków do eliminowania lub wydalania nadmiernej ilości soli z ich tkanek, jak potrafią zwierzęta, ich jedyną obroną jest usuwanie soli przez martwe liście i igły. Rośliny, które nie zrzucają liści co roku, takie jak drzewa iglaste, są szczególnie podatne na nagromadzenie soli.
