Rodzaje protistów, którymi są eukarionty, które nie są zwierzętami, grzybami lub roślinami, obejmują euglenozę, alevolates, stramenopiles, czerwone algi, śluzowce i cienkie kule. Grupa alevolate zawiera orzęski, sporozoany i dinoflagellates. Grupa ta obejmuje okrzemki, złote algi, zielone algi i wodne pleśnie.
Euglenoza, jednokomórkowe protisty, które pływają za pomocą pojedynczej wici, to Euglena oraz Trypanosoma brucei. Caliated protists, które poruszają się pokonując ich rzęski, obejmują Paramecium, Stentor, Vorticella i Tetrahymena thermophila. Sporozoanie obejmują rodzaj Plasmodium, bakterię wywołującą malarię zagrażającą życiu. Dinoflagellates zawierają około 1000 gatunków protistów i są odpowiedzialne za powstawanie trujących czerwonych pływów w środowisku morskim. Okrzemki są głównymi producentami w środowiskach wodnych i główną bazą dla wodnych łańcuchów pokarmowych. Złote algi zawierają ponad 1000 gatunków jednokomórkowych protistów najczęściej występujących w wodach słodkich. Brązowe algi to rweteski i kaczki, które występują najczęściej w słonych wodach. Niektóre formy wodne, takie jak Saprolegnia, są pasożytami ryb, które powodują problemy dla wylęgarni ryb. Czerwone algi zawierają około 6000 gatunków protistów, którzy są prawie wyłącznie morskimi. Formy śluzowe mogą być komórkowe lub bezkomórkowe. Choanoflagellates są jednokomórkowymi wodnymi protistami, którzy mają pojedynczą flagellum otaczającą obrożę mikrokosmków.
