Zalety endoszkieletu obejmują silne właściwości obciążające, a nawet wzrost, podczas gdy wady obejmują mniejszą ochronę i siłę mięśni. Endoskeletony są generalnie spotykane u większych zwierząt z powodu lepszej obsługi wagi, ponieważ egzoszkielety mogą ograniczaj wzrost ze względu na masę.
Endoskeleton odnosi się do wewnętrznego szkieletu, w przeciwieństwie do egzoszkieletu, który odnosi się do zewnętrznego szkieletu. Będąc wewnętrznym, endoszkielet może wytrzymać większą wagę, nie stając się zbyt ciężkim dla organizmu. Egzoszkielet w końcu stanie się niepraktycznie ciężki dla organizmu, tym samym ograniczając jego rozmiar. Ponadto, endoskeleton może rosnąć wraz z organizmem, w przeciwieństwie do egzoszkieletu, który wymaga regularnego linienia, ponieważ jest sztywny i nie rośnie.
Wewnętrzny i pokryty mięśniami i tkankami, endoskeleton zapewnia niewielką ochronę organizmu. Istnieją również mniej sztywne obszary, w których mięśnie mogą się ciągnąć, co skutkuje mniejszą dźwignią.