Wodór nie występuje w czystej postaci w przyrodzie, a zamiast tego jest wytwarzany ze źródła energii pierwotnej, takiego jak paliwa kopalne, energia słoneczna, energia geotermalna i wiatrowa, lub jest wydobywany z innych pierwiastków, takich jak tlen. Wodór znajduje się w otoczeniu lub współistnieje z innymi pierwiastkami na Ziemi, w wodzie i w atmosferze. Wodór jest dość obfity, ale często trudno go wyodrębnić i oddzielić od otaczających minerałów i pierwiastków.
Pierwotne zastosowanie wodoru jest źródłem energii, ale najpierw musi powstać wodór, zanim zostanie przekształcony w użyteczne formy paliwa i elektryczności. W tym celu wytwarza się go w procesie reformingu parowego, który łączy w sobie węglowodory i cząsteczki wody w celu wytworzenia pary lub pary. Wodór na bazie pary można łączyć z innymi substancjami, takimi jak metan, w celu wytworzenia różnych rodzajów paliwa. Technika elektrolizy, w której wykorzystuje się prądy elektryczne do rozłożenia wody na cząsteczki tlenu i wodoru, jest inną metodą wytwarzania wodoru w celu wytworzenia energii elektrycznej. Z ziemi wodór jest wydobywany z różnych minerałów i pierwiastków. W wodzie często współistnieje z tlenem. Wodór tworzy również paliwa kopalne; w tych substancjach często występuje obok węgla. Pomimo swojej przydatności, proces wydobywania wodoru jest często trudny i nieefektywny pod względem czasu i ekonomii.