W mikrobiologii czysta kultura jest kulturą laboratoryjną zawierającą pojedynczy gatunek organizmu, zgodnie z Encyclopædia Britannica. Czysta kultura pochodzi zwykle z kultury mieszanej.
Kultura mieszana jest kulturą zawierającą wiele gatunków. Czysta kultura pochodzi z mieszanej hodowli przez przeniesienie małej próbki do nowego sterylnego podłoża hodowlanego w sposób, który rozprasza poszczególne komórki na powierzchni podłoża. Można go również uzyskać przez rozcieńczenie kolektora próbki przed zaszczepieniem nowego podłoża. Obie metody oddzielają poszczególne komórki, tak że gdy komórki się mnożą, każda komórka tworzy odrębną kolonię. Komórki można następnie wykorzystać do zaszczepienia większej ilości pożywek z zapewnieniem, że obecny jest tylko jeden typ organizmu.