Pokarm, który nie jest odpowiednio trawiony w żołądku, zostaje ostatecznie przepchnięty przez resztę przewodu pokarmowego i opuszcza ciało przez odbytnicę jako stolec. Ciało traktuje niestrawione jedzenie jak każdą inną substancję, której żołądek nie rozpada się.
Niemożność pełnego ekstrakcji składników odżywczych z pożywienia jest znana jako złe wchłanianie. Może to nastąpić z powodu niedoboru lub przerwania enzymów trawiennych. Objawy złego wchłaniania obejmują biegunkę, utratę masy ciała i nieprzyjemnie duże i obraźliwe stolce. Lekarze testują ewentualne złe wchłanianie przez badanie stolca na tłuszcz. W niektórych przypadkach konieczna jest biopsja jelita cienkiego.
