Cykl azotowy w akwarium jest procesem, w którym nowe akwarium przechodzi na kolonie bakterii, według portalu About.com. W miarę jak ryby wydalają odpady i rośliny w głąb akwarium, bakterie wyrastają, aby przekształcić te odpady w mniej toksyczne produkty uboczne. Ryby są zagrożone, dopóki nie będzie wystarczającej ilości bakterii.
W początkowym okresie cyklu azotowego produkty odpadowe ryb rozkładają się na amoniak, który może być toksyczny, jeśli pozostanie na trzy dni lub dłużej. W następnym etapie bakterie utleniają i eliminują amoniak, ale wytwarzają azotyn jako produkt uboczny, który jest również toksyczny dla ryb. W stanie końcowym różne bakterie przekształcają azotyny w azotany, które nie są toksyczne w niskich stężeniach. Regularna zmiana wody pomaga kontrolować poziomy azotanów.