Siłą napędową protonu jest energia generowana z przenoszenia protonów lub elektronów przez przepuszczającą energię błonę komórkową. Energia jest następnie wykorzystywana do wykonywania prac chemicznych, osmotycznych lub mechanicznych.
Siła napędowa protonu istnieje w eukariotach i prokariotach. W eukariotach znajduje się na wewnętrznej błonie mitochondrialnej i jest generowany przez energię z cyklu kwasu cytrynowego. Siła napędowa protonu jest używana do tworzenia ATP z syntazy ATP. W roślinach siła napędowa protonu jest umiejscowiona w błonie tylakoidowej chloroplastów. Siła jest generowana przez reakcję światła podczas fotosyntezy. Używa się go do stworzenia ATP, który jest używany do wiązania CO2.
